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カルバペネム耐性腸内細菌科細菌（carbapenem-resistant Enterobacteriaceae：CRE）感染症は，カルバペネムに非感性の腸内細菌科細菌による感染症である。菌血症や尿路感染症，肺炎，肝胆道系感染症などの原因となりうる。臨床症状は発熱のほか，それぞれの感染病態ごとに様々な症状が認められる。菌種は多くがEscherichia coli，Klebsiella pneumoniaeであるが，Enterobacter属やその他の細菌でもみられる。
カルバペネムを分解可能な酵素であるカルバペネマーゼを産生するCREは，カルバペネマーゼ産生腸内細菌科細菌（carbapenemase-producig Enterobacteriaceae：CPE）と呼ばれ，世界的には，KPC（Klebsiella pneumoniae carbapenemase）型，NDM（New Delhi metallo-β-lactamase）型，OXA（oxacillinase）-48-like型が多い。日本ではIMP（imipenemase）型が多く分離され，KPC型，NDM型，OXA-48-like型は少なく，そのほとんどが海外からの持ち込み例である。またCREの中では，これらカルバペネマーゼ産生株以外にも，しばしば基質拡張型β-ラクタマーゼ（extended spectrum β-lactamase：ESBL）産生をコードする遺伝子やAmpC型β-ラクタマーゼ過剰産生をコードする遺伝子も同時に陽性の株や，ポーリンの欠損の併存による最小発育阻止濃度（minimum inhibitory concentration：MIC）値の上昇株も報告されている。
▶診断のポイント
感染症法の定義では，メロペネムのMIC値が2μg／mL以上，もしくはイミペネムのMIC値が2μg／mL以上かつセフメタゾールのMIC値が64μg／mL以上の腸内細菌科細菌である。この定義ではCPEのほかに，AmpC型β-ラクタマーゼ過剰産生＋外膜の透過性低下による耐性機構なども該当するため，CREか否かの鑑別には遺伝子学的検査などによる精査が必要である。
カルバペネマーゼ産生が疑われる場合には，CarbaNP test，modified carbapenem inactivation methods（mCIM）や，市販の選択培地でスクリーニングをする。メタロ-β-ラクタマーゼが疑われる場合には，SMA（メルカプト酢酸ナトリウム）ディスク法，シカベータ法，カルバペネマーゼ鑑別ディスクplusなどを用いる。メロペネムのMIC値が2μg／mL未満の株の一部についても，カルバペネマーゼ産生菌が認められることがあるため，メロペネムのMIC値が0.25μg／mL以上の株については検査を行うことが望ましい1）。